Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCCAG3Q96C92 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDCCAG3Q96C92 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCCAG3Q96C92 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms