Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX33Q8WV41 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX33Q8WV41 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX33Q8WV41 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms