Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DTX3LQ8TDB6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DTX3LQ8TDB6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DTX3LQ8TDB6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.6 ms