Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC82Q8N4S0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC82Q8N4S0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC82Q8N4S0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC82Q8N4S0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC82Q8N4S0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms