Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PROM2Q8N271 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PROM2Q8N271 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PROM2Q8N271 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PROM2Q8N271 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PROM2Q8N271 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PROM2Q8N271 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PROM2Q8N271 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PROM2Q8N271 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PROM2Q8N271 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PROM2Q8N271 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PROM2Q8N271 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PROM2Q8N271 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PROM2Q8N271 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PROM2Q8N271 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PROM2Q8N271 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms