Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GATAD2AQ86YP4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GATAD2AQ86YP4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GATAD2AQ86YP4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GATAD2AQ86YP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GATAD2AQ86YP4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATAD2AQ86YP4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATAD2AQ86YP4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms