Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTU1Q7Z7A3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTU1Q7Z7A3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTU1Q7Z7A3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms