Protein–RNA interactions for Protein: Q7LG56

RRM2B, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2BQ7LG56 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRM2BQ7LG56 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM2BQ7LG56 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRM2BQ7LG56 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms