Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAPN12Q6ZSI9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN12Q6ZSI9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN12Q6ZSI9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms