Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C9orf47Q6ZRZ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf47Q6ZRZ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms