Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC19Q6DKK2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC19Q6DKK2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC19Q6DKK2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms