Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC9A4Q6AI14 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A4Q6AI14 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A4Q6AI14 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A4Q6AI14 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms