Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1orf53Q5VUE5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1orf53Q5VUE5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
C1orf53Q5VUE5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C1orf53Q5VUE5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1orf53Q5VUE5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1orf53Q5VUE5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C1orf53Q5VUE5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C1orf53Q5VUE5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C1orf53Q5VUE5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
C1orf53Q5VUE5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
C1orf53Q5VUE5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1orf53Q5VUE5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms