Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZK1Q5T2W1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZK1Q5T2W1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZK1Q5T2W1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms