Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
WDR44Q5JSH3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
WDR44Q5JSH3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR44Q5JSH3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR44Q5JSH3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR44Q5JSH3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms