Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CT47A1Q5JQC4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47A1Q5JQC4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CT47A1Q5JQC4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CT47A1Q5JQC4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CT47A1Q5JQC4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47A1Q5JQC4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms