Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KHDC1Q4VXA5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KHDC1Q4VXA5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KHDC1Q4VXA5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms