Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP25-1Q3LHN0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms