Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1BQ3KR37 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1BQ3KR37 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1BQ3KR37 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1BQ3KR37 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms