Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C18orf21Q32NC0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C18orf21Q32NC0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C18orf21Q32NC0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C18orf21Q32NC0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms