Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCK2Q16822 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCK2Q16822 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCK2Q16822 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms