Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85BQ15834 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85BQ15834 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms