Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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