Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
GRIN2AQ12879 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
GRIN2AQ12879 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC42.19■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC42.16■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
GRIN2AQ12879 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
GRIN2AQ12879 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
GRIN2AQ12879 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
GRIN2AQ12879 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC41.9■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
GRIN2AQ12879 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.88■■■■■ 4.29
GRIN2AQ12879 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
GRIN2AQ12879 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
GRIN2AQ12879 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
GRIN2AQ12879 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
GRIN2AQ12879 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
GRIN2AQ12879 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
GRIN2AQ12879 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms