Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
NUP160Q12769 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
NUP160Q12769 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC42.04■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NUP160Q12769 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC41.99■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NUP160Q12769 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
NUP160Q12769 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
NUP160Q12769 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
NUP160Q12769 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
NUP160Q12769 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
NUP160Q12769 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
NUP160Q12769 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
NUP160Q12769 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC41.88■■■■■ 4.3
NUP160Q12769 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC41.83■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
NUP160Q12769 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC41.8■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC41.76■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
NUP160Q12769 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
NUP160Q12769 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NUP160Q12769 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NUP160Q12769 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
NUP160Q12769 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
NUP160Q12769 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NUP160Q12769 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
NUP160Q12769 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NUP160Q12769 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
NUP160Q12769 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
NUP160Q12769 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
NUP160Q12769 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
NUP160Q12769 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
NUP160Q12769 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
NUP160Q12769 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
NUP160Q12769 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
NUP160Q12769 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NUP160Q12769 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
NUP160Q12769 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
NUP160Q12769 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
NUP160Q12769 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
NUP160Q12769 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms