Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC46.16■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC46.14■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC46.13■■■■■ 4.98
HMGXB3Q12766 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
HMGXB3Q12766 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
HMGXB3Q12766 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
HMGXB3Q12766 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
HMGXB3Q12766 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
HMGXB3Q12766 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
HMGXB3Q12766 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
HMGXB3Q12766 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
HMGXB3Q12766 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
HMGXB3Q12766 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
HMGXB3Q12766 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC46.06■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC46.05■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC46.03■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
HMGXB3Q12766 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC45.95■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC45.95■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
HMGXB3Q12766 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC45.93■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC45.9■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC45.88■■■■■ 4.94
HMGXB3Q12766 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.87■■■■■ 4.93
HMGXB3Q12766 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
HMGXB3Q12766 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
HMGXB3Q12766 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
HMGXB3Q12766 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
HMGXB3Q12766 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
HMGXB3Q12766 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
HMGXB3Q12766 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
HMGXB3Q12766 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
HMGXB3Q12766 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.93
HMGXB3Q12766 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC45.78■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
HMGXB3Q12766 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
HMGXB3Q12766 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
HMGXB3Q12766 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
HMGXB3Q12766 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
HMGXB3Q12766 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms