Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC63Q05C16 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC63Q05C16 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC63Q05C16 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC63Q05C16 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC63Q05C16 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms