Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX5Q02548 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX5Q02548 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX5Q02548 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms