Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
XPCQ01831 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
XPCQ01831 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
XPCQ01831 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
XPCQ01831 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
XPCQ01831 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
XPCQ01831 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
XPCQ01831 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
XPCQ01831 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
XPCQ01831 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
XPCQ01831 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
XPCQ01831 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
XPCQ01831 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
XPCQ01831 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
XPCQ01831 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
XPCQ01831 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
XPCQ01831 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
XPCQ01831 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
XPCQ01831 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
XPCQ01831 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
XPCQ01831 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
XPCQ01831 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
XPCQ01831 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
XPCQ01831 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
XPCQ01831 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
XPCQ01831 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
XPCQ01831 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
XPCQ01831 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
XPCQ01831 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
XPCQ01831 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
XPCQ01831 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
XPCQ01831 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
XPCQ01831 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
XPCQ01831 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
XPCQ01831 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
XPCQ01831 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
XPCQ01831 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
XPCQ01831 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
XPCQ01831 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
XPCQ01831 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
XPCQ01831 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
XPCQ01831 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
XPCQ01831 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
XPCQ01831 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
XPCQ01831 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
XPCQ01831 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
XPCQ01831 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
XPCQ01831 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
XPCQ01831 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
XPCQ01831 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
XPCQ01831 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
XPCQ01831 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
XPCQ01831 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
XPCQ01831 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
XPCQ01831 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
XPCQ01831 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
XPCQ01831 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
XPCQ01831 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
XPCQ01831 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
XPCQ01831 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
XPCQ01831 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
XPCQ01831 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
XPCQ01831 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
XPCQ01831 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
XPCQ01831 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
XPCQ01831 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
XPCQ01831 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
XPCQ01831 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
XPCQ01831 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
XPCQ01831 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
XPCQ01831 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
XPCQ01831 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
XPCQ01831 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
XPCQ01831 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
XPCQ01831 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
XPCQ01831 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
XPCQ01831 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
XPCQ01831 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
XPCQ01831 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
XPCQ01831 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
XPCQ01831 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
XPCQ01831 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
XPCQ01831 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
XPCQ01831 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
XPCQ01831 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
XPCQ01831 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
XPCQ01831 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
XPCQ01831 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
XPCQ01831 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
XPCQ01831 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
XPCQ01831 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
XPCQ01831 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
XPCQ01831 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35■■■■□ 3.19
XPCQ01831 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
XPCQ01831 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
XPCQ01831 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
XPCQ01831 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
XPCQ01831 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
XPCQ01831 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
XPCQ01831 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms