Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBN1Q01082 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTBN1Q01082 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN1Q01082 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.5 ms