Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT85P78386 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT85P78386 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT85P78386 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT85P78386 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT85P78386 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT85P78386 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT85P78386 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT85P78386 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT85P78386 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT85P78386 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT85P78386 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT85P78386 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT85P78386 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT85P78386 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT85P78386 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT85P78386 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT85P78386 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT85P78386 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT85P78386 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT85P78386 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT85P78386 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT85P78386 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT85P78386 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT85P78386 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT85P78386 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT85P78386 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT85P78386 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT85P78386 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT85P78386 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT85P78386 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT85P78386 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT85P78386 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT85P78386 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT85P78386 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT85P78386 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT85P78386 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT85P78386 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT85P78386 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT85P78386 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT85P78386 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT85P78386 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT85P78386 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT85P78386 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT85P78386 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT85P78386 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT85P78386 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT85P78386 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT85P78386 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT85P78386 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT85P78386 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT85P78386 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT85P78386 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT85P78386 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT85P78386 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT85P78386 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT85P78386 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT85P78386 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT85P78386 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT85P78386 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT85P78386 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT85P78386 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT85P78386 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT85P78386 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT85P78386 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT85P78386 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT85P78386 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT85P78386 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT85P78386 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT85P78386 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT85P78386 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT85P78386 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT85P78386 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT85P78386 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT85P78386 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT85P78386 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT85P78386 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT85P78386 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT85P78386 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT85P78386 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT85P78386 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT85P78386 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KRT85P78386 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT85P78386 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT85P78386 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT85P78386 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT85P78386 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT85P78386 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT85P78386 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT85P78386 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT85P78386 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT85P78386 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT85P78386 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT85P78386 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT85P78386 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT85P78386 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT85P78386 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT85P78386 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT85P78386 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT85P78386 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms