Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS28P62857 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS28P62857 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS28P62857 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS28P62857 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS28P62857 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS28P62857 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS28P62857 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS28P62857 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS28P62857 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS28P62857 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS28P62857 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS28P62857 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS28P62857 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS28P62857 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS28P62857 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS28P62857 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS28P62857 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS28P62857 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS28P62857 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS28P62857 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS28P62857 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS28P62857 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS28P62857 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS28P62857 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS28P62857 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS28P62857 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS28P62857 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS28P62857 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS28P62857 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS28P62857 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS28P62857 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS28P62857 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS28P62857 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS28P62857 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS28P62857 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS28P62857 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS28P62857 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS28P62857 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS28P62857 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS28P62857 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS28P62857 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS28P62857 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS28P62857 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS28P62857 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS28P62857 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS28P62857 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS28P62857 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS28P62857 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS28P62857 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPS28P62857 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS28P62857 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS28P62857 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPS28P62857 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS28P62857 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPS28P62857 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPS28P62857 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS28P62857 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS28P62857 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS28P62857 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS28P62857 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS28P62857 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS28P62857 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS28P62857 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS28P62857 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS28P62857 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS28P62857 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS28P62857 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS28P62857 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS28P62857 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS28P62857 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS28P62857 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS28P62857 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS28P62857 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS28P62857 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS28P62857 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS28P62857 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS28P62857 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS28P62857 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS28P62857 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS28P62857 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS28P62857 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS28P62857 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS28P62857 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS28P62857 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPS28P62857 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPS28P62857 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPS28P62857 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPS28P62857 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPS28P62857 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS28P62857 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS28P62857 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS28P62857 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS28P62857 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS28P62857 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS28P62857 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS28P62857 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS28P62857 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS28P62857 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS28P62857 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms