Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM3P62310 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM3P62310 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM3P62310 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM3P62310 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM3P62310 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM3P62310 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM3P62310 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM3P62310 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM3P62310 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM3P62310 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM3P62310 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM3P62310 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM3P62310 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM3P62310 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM3P62310 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM3P62310 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM3P62310 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM3P62310 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM3P62310 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM3P62310 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM3P62310 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM3P62310 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM3P62310 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM3P62310 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM3P62310 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM3P62310 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM3P62310 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM3P62310 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM3P62310 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM3P62310 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM3P62310 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM3P62310 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM3P62310 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM3P62310 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM3P62310 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM3P62310 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM3P62310 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM3P62310 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM3P62310 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM3P62310 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM3P62310 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM3P62310 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM3P62310 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM3P62310 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM3P62310 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM3P62310 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM3P62310 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM3P62310 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM3P62310 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM3P62310 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM3P62310 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM3P62310 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM3P62310 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM3P62310 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM3P62310 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM3P62310 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM3P62310 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM3P62310 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM3P62310 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM3P62310 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM3P62310 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM3P62310 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM3P62310 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM3P62310 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM3P62310 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM3P62310 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM3P62310 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM3P62310 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM3P62310 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM3P62310 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM3P62310 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM3P62310 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM3P62310 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSM3P62310 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSM3P62310 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSM3P62310 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM3P62310 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM3P62310 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM3P62310 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM3P62310 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM3P62310 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM3P62310 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM3P62310 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM3P62310 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM3P62310 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM3P62310 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM3P62310 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM3P62310 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM3P62310 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM3P62310 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM3P62310 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM3P62310 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM3P62310 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM3P62310 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM3P62310 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM3P62310 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM3P62310 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM3P62310 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM3P62310 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 590.1 ms