Protein–RNA interactions for Protein: P50851

LRBA, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRBAP50851 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRBAP50851 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRBAP50851 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRBAP50851 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRBAP50851 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRBAP50851 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRBAP50851 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRBAP50851 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRBAP50851 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRBAP50851 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRBAP50851 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRBAP50851 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRBAP50851 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRBAP50851 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRBAP50851 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRBAP50851 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRBAP50851 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRBAP50851 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRBAP50851 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRBAP50851 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRBAP50851 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRBAP50851 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRBAP50851 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRBAP50851 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRBAP50851 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRBAP50851 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRBAP50851 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRBAP50851 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRBAP50851 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRBAP50851 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRBAP50851 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRBAP50851 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRBAP50851 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRBAP50851 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRBAP50851 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRBAP50851 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRBAP50851 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRBAP50851 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRBAP50851 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRBAP50851 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRBAP50851 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRBAP50851 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRBAP50851 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRBAP50851 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRBAP50851 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRBAP50851 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRBAP50851 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRBAP50851 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRBAP50851 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRBAP50851 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRBAP50851 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRBAP50851 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRBAP50851 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRBAP50851 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRBAP50851 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRBAP50851 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRBAP50851 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRBAP50851 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRBAP50851 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRBAP50851 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRBAP50851 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRBAP50851 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRBAP50851 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRBAP50851 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRBAP50851 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRBAP50851 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRBAP50851 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRBAP50851 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRBAP50851 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRBAP50851 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRBAP50851 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRBAP50851 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRBAP50851 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRBAP50851 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRBAP50851 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRBAP50851 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRBAP50851 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRBAP50851 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRBAP50851 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRBAP50851 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRBAP50851 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRBAP50851 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRBAP50851 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRBAP50851 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRBAP50851 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRBAP50851 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRBAP50851 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRBAP50851 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRBAP50851 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRBAP50851 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRBAP50851 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRBAP50851 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRBAP50851 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRBAP50851 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRBAP50851 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRBAP50851 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRBAP50851 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRBAP50851 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRBAP50851 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRBAP50851 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms