Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPAP49450 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPAP49450 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPAP49450 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPAP49450 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPAP49450 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPAP49450 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPAP49450 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPAP49450 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPAP49450 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPAP49450 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPAP49450 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPAP49450 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPAP49450 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPAP49450 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPAP49450 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPAP49450 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPAP49450 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPAP49450 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPAP49450 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPAP49450 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPAP49450 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPAP49450 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPAP49450 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPAP49450 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPAP49450 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPAP49450 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPAP49450 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPAP49450 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPAP49450 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPAP49450 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPAP49450 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPAP49450 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPAP49450 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPAP49450 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPAP49450 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPAP49450 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPAP49450 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPAP49450 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPAP49450 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPAP49450 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPAP49450 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPAP49450 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPAP49450 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPAP49450 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPAP49450 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPAP49450 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPAP49450 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPAP49450 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPAP49450 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPAP49450 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPAP49450 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPAP49450 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPAP49450 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPAP49450 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPAP49450 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPAP49450 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPAP49450 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPAP49450 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPAP49450 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPAP49450 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPAP49450 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPAP49450 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPAP49450 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPAP49450 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPAP49450 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPAP49450 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPAP49450 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPAP49450 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPAP49450 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPAP49450 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPAP49450 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPAP49450 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPAP49450 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPAP49450 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPAP49450 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPAP49450 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPAP49450 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPAP49450 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPAP49450 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPAP49450 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPAP49450 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPAP49450 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPAP49450 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPAP49450 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPAP49450 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPAP49450 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPAP49450 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPAP49450 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPAP49450 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPAP49450 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPAP49450 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPAP49450 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPAP49450 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPAP49450 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPAP49450 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPAP49450 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPAP49450 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPAP49450 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPAP49450 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms