Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKI67P46013 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MKI67P46013 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MKI67P46013 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKI67P46013 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKI67P46013 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MKI67P46013 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MKI67P46013 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKI67P46013 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKI67P46013 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKI67P46013 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKI67P46013 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MKI67P46013 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKI67P46013 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKI67P46013 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKI67P46013 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKI67P46013 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKI67P46013 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKI67P46013 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKI67P46013 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKI67P46013 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKI67P46013 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MKI67P46013 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MKI67P46013 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKI67P46013 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKI67P46013 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKI67P46013 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKI67P46013 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MKI67P46013 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKI67P46013 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKI67P46013 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MKI67P46013 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKI67P46013 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKI67P46013 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKI67P46013 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKI67P46013 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MKI67P46013 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKI67P46013 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKI67P46013 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKI67P46013 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKI67P46013 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKI67P46013 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKI67P46013 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKI67P46013 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MKI67P46013 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MKI67P46013 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MKI67P46013 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MKI67P46013 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKI67P46013 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKI67P46013 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKI67P46013 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKI67P46013 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKI67P46013 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKI67P46013 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MKI67P46013 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKI67P46013 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKI67P46013 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MKI67P46013 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MKI67P46013 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKI67P46013 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKI67P46013 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKI67P46013 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKI67P46013 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKI67P46013 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MKI67P46013 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKI67P46013 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKI67P46013 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKI67P46013 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKI67P46013 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKI67P46013 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MKI67P46013 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKI67P46013 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKI67P46013 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKI67P46013 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MKI67P46013 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKI67P46013 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MKI67P46013 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKI67P46013 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKI67P46013 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKI67P46013 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MKI67P46013 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKI67P46013 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKI67P46013 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MKI67P46013 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKI67P46013 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKI67P46013 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKI67P46013 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKI67P46013 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKI67P46013 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKI67P46013 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKI67P46013 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKI67P46013 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MKI67P46013 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKI67P46013 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKI67P46013 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKI67P46013 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKI67P46013 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKI67P46013 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKI67P46013 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKI67P46013 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms