Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CBP42338 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3CBP42338 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CBP42338 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms