Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNFP41002 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNFP41002 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNFP41002 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNFP41002 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNFP41002 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNFP41002 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNFP41002 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNFP41002 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNFP41002 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNFP41002 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNFP41002 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNFP41002 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNFP41002 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNFP41002 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNFP41002 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNFP41002 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNFP41002 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNFP41002 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNFP41002 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNFP41002 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNFP41002 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNFP41002 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNFP41002 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNFP41002 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNFP41002 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNFP41002 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNFP41002 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNFP41002 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNFP41002 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNFP41002 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNFP41002 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNFP41002 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNFP41002 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNFP41002 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNFP41002 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNFP41002 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNFP41002 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNFP41002 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNFP41002 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNFP41002 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNFP41002 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNFP41002 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNFP41002 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNFP41002 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNFP41002 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNFP41002 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNFP41002 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNFP41002 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNFP41002 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNFP41002 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNFP41002 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNFP41002 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNFP41002 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNFP41002 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNFP41002 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNFP41002 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNFP41002 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNFP41002 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNFP41002 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNFP41002 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNFP41002 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNFP41002 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNFP41002 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNFP41002 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNFP41002 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNFP41002 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNFP41002 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNFP41002 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNFP41002 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNFP41002 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNFP41002 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNFP41002 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNFP41002 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNFP41002 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNFP41002 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNFP41002 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNFP41002 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNFP41002 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNFP41002 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNFP41002 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNFP41002 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNFP41002 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNFP41002 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNFP41002 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNFP41002 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNFP41002 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNFP41002 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNFP41002 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNFP41002 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNFP41002 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNFP41002 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNFP41002 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNFP41002 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNFP41002 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNFP41002 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNFP41002 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNFP41002 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNFP41002 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNFP41002 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms