Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4A3P38919 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF4A3P38919 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4A3P38919 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A3P38919 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF4A3P38919 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms