Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL1P37235 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL1P37235 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPCAL1P37235 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPCAL1P37235 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPCAL1P37235 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAL1P37235 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms