Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN7P35236 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPN7P35236 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN7P35236 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms