Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CPS1P31327 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CPS1P31327 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CPS1P31327 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CPS1P31327 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CPS1P31327 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CPS1P31327 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CPS1P31327 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CPS1P31327 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CPS1P31327 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CPS1P31327 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CPS1P31327 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CPS1P31327 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CPS1P31327 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CPS1P31327 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CPS1P31327 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CPS1P31327 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CPS1P31327 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CPS1P31327 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CPS1P31327 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CPS1P31327 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CPS1P31327 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CPS1P31327 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CPS1P31327 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CPS1P31327 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CPS1P31327 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CPS1P31327 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CPS1P31327 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CPS1P31327 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CPS1P31327 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CPS1P31327 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CPS1P31327 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CPS1P31327 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CPS1P31327 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CPS1P31327 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CPS1P31327 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CPS1P31327 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CPS1P31327 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CPS1P31327 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CPS1P31327 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CPS1P31327 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CPS1P31327 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CPS1P31327 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CPS1P31327 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CPS1P31327 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CPS1P31327 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CPS1P31327 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CPS1P31327 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CPS1P31327 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CPS1P31327 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CPS1P31327 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CPS1P31327 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CPS1P31327 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CPS1P31327 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CPS1P31327 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CPS1P31327 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CPS1P31327 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CPS1P31327 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CPS1P31327 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CPS1P31327 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CPS1P31327 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CPS1P31327 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CPS1P31327 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CPS1P31327 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CPS1P31327 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
CPS1P31327 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CPS1P31327 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CPS1P31327 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CPS1P31327 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CPS1P31327 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CPS1P31327 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CPS1P31327 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CPS1P31327 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CPS1P31327 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CPS1P31327 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CPS1P31327 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CPS1P31327 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CPS1P31327 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CPS1P31327 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CPS1P31327 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CPS1P31327 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CPS1P31327 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CPS1P31327 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CPS1P31327 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CPS1P31327 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CPS1P31327 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CPS1P31327 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CPS1P31327 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CPS1P31327 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CPS1P31327 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CPS1P31327 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CPS1P31327 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CPS1P31327 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CPS1P31327 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CPS1P31327 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CPS1P31327 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CPS1P31327 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CPS1P31327 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CPS1P31327 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CPS1P31327 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms