Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLD1P28340 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLD1P28340 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLD1P28340 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLD1P28340 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLD1P28340 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
POLD1P28340 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLD1P28340 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
POLD1P28340 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLD1P28340 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLD1P28340 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLD1P28340 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
POLD1P28340 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
POLD1P28340 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLD1P28340 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLD1P28340 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLD1P28340 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLD1P28340 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
POLD1P28340 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
POLD1P28340 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
POLD1P28340 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
POLD1P28340 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
POLD1P28340 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
POLD1P28340 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
POLD1P28340 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
POLD1P28340 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
POLD1P28340 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLD1P28340 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
POLD1P28340 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
POLD1P28340 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLD1P28340 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLD1P28340 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLD1P28340 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLD1P28340 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
POLD1P28340 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
POLD1P28340 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
POLD1P28340 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLD1P28340 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLD1P28340 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
POLD1P28340 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
POLD1P28340 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
POLD1P28340 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
POLD1P28340 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
POLD1P28340 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLD1P28340 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLD1P28340 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLD1P28340 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLD1P28340 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLD1P28340 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLD1P28340 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLD1P28340 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
POLD1P28340 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
POLD1P28340 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLD1P28340 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLD1P28340 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLD1P28340 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLD1P28340 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLD1P28340 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
POLD1P28340 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLD1P28340 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLD1P28340 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
POLD1P28340 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
POLD1P28340 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
POLD1P28340 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
POLD1P28340 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
POLD1P28340 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
POLD1P28340 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
POLD1P28340 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
POLD1P28340 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
POLD1P28340 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLD1P28340 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLD1P28340 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLD1P28340 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLD1P28340 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLD1P28340 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLD1P28340 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLD1P28340 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLD1P28340 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
POLD1P28340 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
POLD1P28340 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
POLD1P28340 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
POLD1P28340 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLD1P28340 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
POLD1P28340 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLD1P28340 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLD1P28340 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
POLD1P28340 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLD1P28340 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLD1P28340 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
POLD1P28340 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLD1P28340 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLD1P28340 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLD1P28340 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLD1P28340 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLD1P28340 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLD1P28340 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLD1P28340 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLD1P28340 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
POLD1P28340 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
POLD1P28340 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms