Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR2AP28223 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTR2AP28223 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms