Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VAMP1P23763 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAMP1P23763 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms