Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
S100A1P23297 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
S100A1P23297 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
S100A1P23297 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
S100A1P23297 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
S100A1P23297 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
S100A1P23297 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
S100A1P23297 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
S100A1P23297 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
S100A1P23297 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
S100A1P23297 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
S100A1P23297 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
S100A1P23297 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
S100A1P23297 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
S100A1P23297 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S100A1P23297 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
S100A1P23297 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
S100A1P23297 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
S100A1P23297 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
S100A1P23297 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
S100A1P23297 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
S100A1P23297 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
S100A1P23297 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
S100A1P23297 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
S100A1P23297 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
S100A1P23297 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
S100A1P23297 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
S100A1P23297 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
S100A1P23297 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
S100A1P23297 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S100A1P23297 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S100A1P23297 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S100A1P23297 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
S100A1P23297 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S100A1P23297 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S100A1P23297 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S100A1P23297 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S100A1P23297 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S100A1P23297 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
S100A1P23297 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
S100A1P23297 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
S100A1P23297 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
S100A1P23297 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
S100A1P23297 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
S100A1P23297 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
S100A1P23297 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
S100A1P23297 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
S100A1P23297 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
S100A1P23297 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
S100A1P23297 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
S100A1P23297 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
S100A1P23297 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
S100A1P23297 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
S100A1P23297 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
S100A1P23297 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
S100A1P23297 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
S100A1P23297 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
S100A1P23297 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
S100A1P23297 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
S100A1P23297 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
S100A1P23297 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
S100A1P23297 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
S100A1P23297 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
S100A1P23297 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
S100A1P23297 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
S100A1P23297 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
S100A1P23297 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
S100A1P23297 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
S100A1P23297 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
S100A1P23297 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
S100A1P23297 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
S100A1P23297 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
S100A1P23297 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
S100A1P23297 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
S100A1P23297 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
S100A1P23297 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
S100A1P23297 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
S100A1P23297 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
S100A1P23297 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
S100A1P23297 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
S100A1P23297 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
S100A1P23297 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
S100A1P23297 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
S100A1P23297 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
S100A1P23297 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
S100A1P23297 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
S100A1P23297 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
S100A1P23297 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
S100A1P23297 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
S100A1P23297 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
S100A1P23297 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
S100A1P23297 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
S100A1P23297 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
S100A1P23297 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
S100A1P23297 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
S100A1P23297 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
S100A1P23297 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
S100A1P23297 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
S100A1P23297 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
S100A1P23297 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms