Protein–RNA interactions for Protein: P15863

PAX1, Paired box protein Pax-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX1P15863 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX1P15863 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX1P15863 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX1P15863 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX1P15863 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX1P15863 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAX1P15863 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAX1P15863 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAX1P15863 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX1P15863 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX1P15863 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX1P15863 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX1P15863 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX1P15863 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX1P15863 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX1P15863 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX1P15863 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX1P15863 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX1P15863 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX1P15863 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX1P15863 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX1P15863 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX1P15863 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAX1P15863 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAX1P15863 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PAX1P15863 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAX1P15863 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAX1P15863 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAX1P15863 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAX1P15863 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX1P15863 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX1P15863 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX1P15863 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX1P15863 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX1P15863 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX1P15863 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX1P15863 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX1P15863 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX1P15863 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX1P15863 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX1P15863 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX1P15863 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX1P15863 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX1P15863 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX1P15863 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX1P15863 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX1P15863 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX1P15863 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX1P15863 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX1P15863 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX1P15863 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX1P15863 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX1P15863 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX1P15863 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX1P15863 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX1P15863 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX1P15863 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX1P15863 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX1P15863 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX1P15863 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX1P15863 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX1P15863 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX1P15863 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX1P15863 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAX1P15863 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX1P15863 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX1P15863 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX1P15863 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX1P15863 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX1P15863 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX1P15863 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX1P15863 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX1P15863 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX1P15863 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX1P15863 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX1P15863 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX1P15863 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX1P15863 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX1P15863 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX1P15863 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX1P15863 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX1P15863 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX1P15863 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX1P15863 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX1P15863 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX1P15863 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX1P15863 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX1P15863 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX1P15863 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX1P15863 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX1P15863 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX1P15863 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX1P15863 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX1P15863 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX1P15863 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX1P15863 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX1P15863 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX1P15863 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX1P15863 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX1P15863 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms