Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAMP11215 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAMP11215 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAMP11215 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAMP11215 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms