Protein–RNA interactions for Protein: P0C672

TSPAN19, Putative tetraspanin-19, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN19P0C672 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN19P0C672 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN19P0C672 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN19P0C672 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN19P0C672 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN19P0C672 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN19P0C672 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms