Protein–RNA interactions for Protein: P08173

CHRM4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM4P08173 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM4P08173 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM4P08173 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM4P08173 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM4P08173 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRM4P08173 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRM4P08173 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRM4P08173 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRM4P08173 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM4P08173 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM4P08173 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM4P08173 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM4P08173 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms